Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5bQ0V8T8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms