Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms