Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms