Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms