Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F13bQ07968 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms