Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MestQ07646 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MestQ07646 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms