Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AmbpQ07456 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms