Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms