Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cab39Q06138 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms