Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms