Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms