Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms