Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms