Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms