Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms