Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms