Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms