Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms