Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnb1Q02248 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms