Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms