Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col1a2Q01149 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms