Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms