Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms