Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms