Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabpb1Q00420 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms