Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Flt3Q00342 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms