Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms