Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shc1P98083 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shc1P98083 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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