Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama4P97927 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms