Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IhhP97812 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IhhP97812 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IhhP97812 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IhhP97812 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IhhP97812 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IhhP97812 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IhhP97812 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IhhP97812 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IhhP97812 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms