Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx2P97474 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms