Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms