Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms