Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh6P97326 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms