Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrkdcP97313 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms