Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms