Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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