Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx1P81068 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx1P81068 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200 ms