Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx1P80205 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Otx1P80205 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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