Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tp53bp1P70399 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tp53bp1P70399 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tp53bp1P70399 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tp53bp1P70399 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tp53bp1P70399 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tp53bp1P70399 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tp53bp1P70399 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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