Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms