Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfixP70257 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NfixP70257 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NfixP70257 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NfixP70257 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NfixP70257 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfixP70257 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfixP70257 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfixP70257 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfixP70257 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms