Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1P63239 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1P63239 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms