Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crnkl1P63154 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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