Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl23P62830 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl23P62830 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms