Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps11P62281 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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