Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2nP61089 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms