Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab8bP61028 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms