Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chp1P61022 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms