Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms